Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228bQ497Q6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms