Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc10Q3TLI0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms