Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Xrn1P97789 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Xrn1P97789 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Xrn1P97789 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms