Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme1P97371 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme1P97371 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme1P97371 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme1P97371 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme1P97371 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme1P97371 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psme1P97371 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psme1P97371 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psme1P97371 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psme1P97371 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms