Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epb41P48193 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms