Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.6 ms