Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb9P28076 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms