Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NclP09405 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NclP09405 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NclP09405 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NclP09405 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NclP09405 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NclP09405 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NclP09405 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NclP09405 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NclP09405 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NclP09405 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NclP09405 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NclP09405 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NclP09405 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NclP09405 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NclP09405 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NclP09405 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NclP09405 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NclP09405 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NclP09405 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NclP09405 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NclP09405 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NclP09405 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NclP09405 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NclP09405 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NclP09405 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NclP09405 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NclP09405 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NclP09405 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NclP09405 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NclP09405 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NclP09405 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NclP09405 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NclP09405 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NclP09405 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NclP09405 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NclP09405 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NclP09405 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NclP09405 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NclP09405 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NclP09405 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NclP09405 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NclP09405 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NclP09405 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NclP09405 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NclP09405 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NclP09405 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms