Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01725 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01725 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01725 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01725 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01725 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01725 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01725 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01725 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01725 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01725 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01725 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01725 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01725 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms