Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dll3O88516 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dll3O88516 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240 ms