Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f6O54917 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms