Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chil3O35744 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms