Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabep1O35551 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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