Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfx7F8VPJ6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfx7F8VPJ6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rfx7F8VPJ6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.9 ms