Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrt2E9PUL5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt2E9PUL5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt2E9PUL5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt2E9PUL5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms