Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hacd4A2AKM2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd4A2AKM2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms