Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms