Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms