Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod3Q9R0E1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms