Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Gpc1Q9QZF2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Gpc1Q9QZF2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Gpc1Q9QZF2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc1Q9QZF2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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