Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms