Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a4bQ9ES61 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms