Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx12Q9ER00 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms