Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms