Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933402E13RikQ9D4D2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms