Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms