Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms