Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lactb2Q99KR3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lactb2Q99KR3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lactb2Q99KR3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lactb2Q99KR3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lactb2Q99KR3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lactb2Q99KR3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lactb2Q99KR3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms