Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dkk4Q8VEJ3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk4Q8VEJ3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms