Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6aQ78XR0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6aQ78XR0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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