Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms