Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbtb40Q6PCS8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms