Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NipblQ6KCD5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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