Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Knl1Q66JQ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms