Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Mre11Q61216 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms