Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms