Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdc1Q5PSV9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdc1Q5PSV9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms