Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bop1P97452 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bop1P97452 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms