Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme1P97371 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme1P97371 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms