Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms