Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5cP41230 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms