Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3P21107 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3P21107 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms