Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spi1P17433 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spi1P17433 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spi1P17433 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms