Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01668 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01668 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01668 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01668 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01668 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01668 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01668 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01668 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01668 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01668 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01668 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01668 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01668 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01668 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01668 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01668 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01668 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01668 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01668 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01668 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01668 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms