Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f6O54917 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms