Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8247F6VRJ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms