Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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