Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp42B2RQC2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms