Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdc27A2A6Q5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms