Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp4Q9Z1N6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms